Les cotisations d'assurance maladie peuvent être déduites de vos revenus, mais les modalités diffèrent s’il s'agit d'une cotisation versée en Suisse (LAMal) ou en France (STFS/URSSAF) : 
   • La cotisation suisse à la LAMal est déductible du revenu catégoriel, c'est-à-dire directement du montant de votre salaire ou pension de source suisse, avant conversion de ce revenu en euros. 
   • La cotisation versée au Service des Travailleurs Frontaliers en Suisse (URSSAF/STFS) est quant à elle déductible de votre revenu global et doit être portée à la ligne 6DD 'Déductions diverses' de votre déclaration d'ensemble des revenus (formulaire 2042-C). 

Attention, les cotisations à une complémentaire santé (mutuelle ou autre assurance santé privée) ne sont jamais déductibles, qu'elles soient versées en France ou à l'étranger.
Si vous avez opté pour l'assurance maladie en France, vous devez effectuer d'autres démarches. Chaque année, à partir du mois de septembre, le Service des Travailleurs Frontaliers en Suisse (URSSAF/STFS) vous invite à déclarer vos revenus perçus au cours de l'année précédente, afin d'actualiser la base de calcul de votre cotisation maladie pour l'année à venir. Cette déclaration s'effectue directement depuis votre compte sur Urssaf.fr. Pour en savoir plus, consultez le site dédié de l'URSSAF et la foire aux questions du STFS, disponible sur le site des services de l'État en Haute-Savoie.